围绕现代物流的学科发展方向，结合重庆市经济建设和社会发展的现实需求，现代物流重庆市重点实验室主要在以下四个方向开展研究：①现代物流与供应链理论与方法；②现代物流与先进制造业协同；③物流信息系统及物流流程优化；④逆向物流基础理论与应用。

(1) 现代物流与供应链理论与方法研究

在现代物流与供应链理论与方法研究方向，主要针对现代物流模式与供应链管理、内陆物流与保税物流管理、应急物流管理和物流金融等内容进行研究。

(2) 现代物流与先进制造业协同研究

在现代物流与先进制造业协同研究方向，主要针对现代物流业与先进制造业的协同共生机理、现代物流与先进制造的信息集成、现代物流与先进制造的业务协同等内容进行研究。

(3) 物流信息系统及物流流程优化研究

在物流信息系统及物流流程优化研究方向，主要针对物流信息系统规划设计及应用、基于信息技术的物流流程优化、基于数据挖掘的物流信息智能分析技术等内容进行研究。

(4) 逆向物流基础理论与应用技术研究

在逆向物流基础理论与应用技术研究方向，主要针对面向环境和资源的逆向物流网络设计、面向环境和资源的逆向物流生产计划、面向环境和资源的逆向供应链协调策略等内容进行研究。